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第1章 导论1

1.1 信息和信息系统1

1.1.1 数据和信息1

1.1.2 信息的特点2

1.1.3 信息的作用4

1.1.4 信息系统5

1.2 生物多样性6

1.2.1 生物多样性与生物多样性科学6

1.2.2 生物多样性的价值7

1.3 生物多样性信息系统9

1.3.1 生物多样性信息系统的特点9

1.3.2 生物多样性信息系统的相关部分及其科学数据库11

1.3.3 集成的生物多样性信息系统12

1.3.4 信息系统技术和技术支撑系统14

1.3.5 利用生物多样性信息的动机和用户17

1.3.6 生物多样性信息系统在生物多样性科学研究中的重要性19

1.4 生物多样性信息系统发展现状20

1.4.1 发达国家生物多样性信息系统发展现状20

1.4.2 中国科研信息系统发展现状21

第2章 生物多样性信息系统数据规范25

2.1 元数据库25

2.1.1 元数据和元数据库25

2.1.2 网络上的元数据26

2.1.3 元数据的注册27

2.1.4 元数据库的内容28

2.1.5 元数据库的建立31

2.2.1 什么是数据字典32

2.2.2 建立数据字典的目的32

2.2 数据字典32

2.2.3 元数据和数据字典的区别33

2.2.4 数据字典的内容33

2.2.5 数据字典的建立过程34

2.3 实例：中国生物多样性元数据库35

2.4 生物多样性信息分类与编码42

2.5 中国生物多样性信息系统数据字典和元数据标准46

第3章 保护生物多样性所需的信息及管理工具47

3.1 保护生物多样性所需的信息47

3.1.1 信息交流的管理50

3.2 实例：中国国家数据库51

3.1.2 地方性信息的管理51

3.1.3 国家组织对保护信息的管理51

3.3 数据管理工具52

3.3.1 数据管理53

3.3.2 地理信息系统（GIS）55

3.3.3 文本的管理和整合59

3.3.4 电脑化现存数据的工具59

3.3.5 调和工具60

3.3.6 环境同义词典62

3.3.7 其他的改进工具63

3.4 报告、分析和建模工具64

3.4.1 物理建模和生态学过程64

3.4.3 建模和政策制定65

3.4.2 风险65

第4章 生物多样性信息系统的技术实现66

4.1 计算机网络技术66

4.1.1 计算机网络概述66

4.1.2 Internet69

4.1.3 TCP/IP协议70

4.1.4 IP地址和域名71

4.1.5 计算机的通信方式73

4.1.6 Internet提供的主要服务74

4.1.7 Internet提供的其他服务76

4.1.8 Internet网络浏览工具78

4.1.9 进入Internet的方式80

4.2.1 数据库的发展历史和基本概念82

4.2 数据库管理信息系统82

4.2.2 网络数据库系统的结构85

4.2.3 并行数据库技术87

4.2.4 分布工数据库与联邦数据库技术88

4.2.5 数据库的互操作89

4.2.6 面向对象数据库系统与多媒体数据库技术93

4.2.7 模糊数据库与演绎数据库技术95

4.2.8 与Internet有关的数据库技术96

4.3 空间信息技术101

4.3.1 概述101

4.3.2 3S技术102

4.3.3 在生物多样性科学研究中的应用104

4.4.1 概述109

4.4 WebGIS109

4.4.2 设计思想110

4.4.3 几种WebGIS的比较111

4.4.4 应用前景113

4.5 生物多样性信息系统的网络构建114

4.6 工具的选择115

4.6.1 软件选择116

4.6.2 硬件选择116

4.6.3 选择过程117

4.6.4 数据管理系统的选择117

4.6.5 CIS的选择118

4.6.6 生物多样性应用软件119

4.6.7 网络之外的信息发布工具119

4.7 信息的广泛利用120

4.7.1 信息交换标准121

4.7.2 信息表达123

4.7.3 信息发布124

4.7.4 电子出版物127

第5章 生物多样性信息系统的规划与管理129

5.1 数据采集和管理129

5.1.1 数据类型130

5.1.2 确定数据需求132

5.1.3 数据格式133

5.1.4 数据收集和管理策略136

5.1.5 管理者的职责138

5.1.6 标准和指南139

5.2 信息系统的规划141

5.2.1 系统规划141

5.2.2 数据策略142

5.2.4 对策143

5.2.3 队伍建设143

5.3 数据评估技术144

5.3.1 信息系统的评价144

5.3.2 信息系统的建设重点144

5.3.3 数据分析与评估145

5.3.4 固有时空尺度147

5.3.5 信息系统技术评估147

5.3.6 支撑系统技术评估148

5.4 信息管理成功的标准149

5.4.1 内在标准149

5.4.2 外在标准150

5.5.1 信息需求和可提供的信息资源151

5.5 组织机构能力的发展151

5.5.2 组织机构的能力建设152

5.5.3 技术选择152

5.5.4 人力资源和培训153

5.5.5 财政预算154

5.6 信息管理的合法性154

5.6.1 关于立法的信息154

5.6.2 国际法的来源155

5.6.3 主要法律条款157

5.7 中国的生物多样性信息管理建设159

5.7.1 信息管理体系建设159

5.7.2 信息设施建设160

5.7.3 信息系统建设162

5.8 小结164

第6章 国际流行的技术和解决方案166

6.1 SPECIES 2000166

6.1.1 目的166

6.1.2 组成167

6.1.3 开发169

6.2 票据交换所机制（CHM）170

6.2.1 概述170

6.2.2 CHM的目标172

6.2.3 CHM与《生物多样性公约》174

6.2.4 涉及CHM的COP决议176

6.2.5 CBD决策过程和CHM177

6.2.6 CHM的热点问题179

6.2.7 CHM和模式变化184

6.3 21世纪生物多样性信息网络（BIN21）185

6.3.1 BIN21185

6.3.2 历史背景185

6.3.3 国际合作和各地区的努力187

6.3.4 BIN21的未来188

6.4 生物多样性特殊兴趣的网络（SIN）189

6.4.1 功能和活动189

6.4.2 组织189

6.4.3 质量控制190

6.4.4 标准191

6.4.5 参与和共享194

6.4.6 同其他SIN的合作195

6.4.7 网络出版（e-publishing）195

6.4.8 SIN的分布式数据库结构196

6.4.9 数字图书馆197

6.4.10 自动处理199

6.4.11 主要讨论的内容199

6.4.12 BIN21节点201

6.4.13 运行机制203

第7章 中国生物多样性信息管理的艰难探索205

7.1 数据资源现状205

7.1.1 机构数据集调查内容与方法206

7.1.2 机构调查结果分析207

7.2 数据管理能力建设211

7.2.1 数据管理能力建设现状评价211

7.2.2 数据管理机构的建设214

7.3.1 数据库的开发现状220

7.3 中国生物多样性信息系统现状220

7.3.2 信息系统与信息网络的建设现状221

7.3.3 面临的问题221

7.4 中国生物多样性信息系统的结构设计222

7.4.1 逻辑结构222

7.4.2 组织结构223

7.5 中国生物多样性信息系统（CBIS）简介224

7.5.1 良好的信息积累224

7.5.2 目标224

7.5.3 概念设计225

7.5.4 CBIS的组织结构226

7.5.5 建设进展227

7.6.1 中国微生物资源数据库229

7.6 中国生物多样性信息系统实例简介229

7.6.2 中国科学院信息中心内陆水体生物学分部Web数据库232

7.6.3 上海市生物多样性信息系统235

第8章 全球主要的生物多样性信息资源241

8.1 生物多样性信息源243

8.1.1 图书馆、书目和书目数据库243

8.1.2 国家级生物多样性信息中心244

8.1.3 国家级生物多样性评价246

8.1.4 全球和区域评价248

8.1.5 在线信息源252

8.1.6 CD-ROM和磁盘256

8.1.7 数据源的目录260

8.2.1 国际植物园保护联盟262

8.2 其他与生物多样性研究相关的网站简介262

8.2.2 国际物种信息系统263

8.2.3 世界资源研究所（WRI）263

8.2.4 生物多样性信息网络（BIN21）263

8.2.5 生物多样性保护信息系统（BCIS）264

8.2.6 美国国家卫生研究院国家医学图书馆国家生物技术信息中心（NCBI）265

8.2.7 世界保护监测中心（WCMC）266

8.2.8 美国自然保护组织（TNC）271

8.2.9 全球生物多样性信息机构（GBIF）271

8.3 生物多样性应用软件272

附录A 中国生物多样性信息系统数据集标准277

附录B 与生物多样性研究相关的缩略语及URL286

参考文献322

后记327